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张晓明教授:水螅基因组测序中的唯一华人

 (张晓明教授及其实验室人员,左一为张晓明教授)

近日,各大媒体纷纷报道了“水螅基因组测序完成”的消息。(Nature 464, 592-596| doi:10.1038/nature08830)

水螅Hydra是生命科学研究中的“元老”,已被科学家描述并研究了300余年。经基因组测序,水螅基因组的基因数目与人类相似,且两者有诸多相同基因。此外令科学家们惊讶的是,水螅存在与人类的两种神经系统疾病,亨廷顿舞蹈症(Huntington's disease)和阿尔茨海默氏症(Alzheimer's disease),相关的基因。

水螅基因组测序项目启动于2004年,由美国国家人类基因组研究所(NHGRI)提供研究资金,历时5年,于2009年4月完成,共有来自美国、德国、奥地利及日本的20个研究机构的研究人员参与。其中唯一一人为华人,即来自美国堪萨斯大学医学中心的张晓明教授。
张晓明教授,1982年毕业于首都医科大学,后远赴美国,师从堪萨斯大学医学中心的Sarras MP Jr.教授及Morrison DC教授,1993年获PhD学位,此后再于加利福尼亚大学攻读博士后。

张晓明教授,现任堪萨斯大学医学中心解剖与细胞生物学系副教授,是水螅相关研究的资深专家,他1993年即在Dev Biol上发表了其第一篇有关水螅的文章:Extracellular matrix (mesoglea) of Hydra vulgaris III. Formation and function during morphogenesis of hydra cell aggregates。至今他已发表SCI文章30余篇,其领衔的实验室也在此方面享有一定国际地位。

参考文献:Nature 464, 592-596 (25 March 2010) | doi:10.1038/nature08830; Received 9 April 2009; Accepted 11 January 2010; Published online 14 March 2010

The dynamic genome of Hydra

The freshwater cnidarian Hydra was first described in 17021 and has been the object of study for 300 years. Experimental studies of Hydra between 1736 and 1744 culminated in the discovery of asexual reproduction of an animal by budding, the first description of regeneration in an animal, and successful transplantation of tissue between animals2. Today, Hydra is an important model for studies of axial patterning3, stem cell biology4 and regeneration5. Here we report the genome of Hydra magnipapillata and compare it to the genomes of the anthozoan Nematostella vectensis6 and other animals. The Hydra genome has been shaped by bursts of transposable element expansion, horizontal gene transfer, trans-splicing, and simplification of gene structure and gene content that parallel simplification of the Hydra life cycle. We also report the sequence of the genome of a novel bacterium stably associated with H. magnipapillata. Comparisons of the Hydra genome to the genomes of other animals shed light on the evolution of epithelia, contractile tissues, developmentally regulated transcription factors, the Spemann–Mangold organizer, pluripotency genes and the neuromuscular junction.

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    摘要
    经基因组测序,水螅基因组的基因数目与人类相似,且两者有诸多相同基因。此外令科学家们惊讶的是,水螅存在与人类的两种神经系统疾病,亨廷顿舞蹈症(Huntington's disease)和阿尔茨海默氏症(Alzheimer's disease),相关的基因。
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