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海洋生物的基因组重排研究

(Figure:Sagittal section of a sea lamprey embryo)

     像桡足类和纤毛虫这些后生动物(metazoan),在发育过程中会经历大量的基因组重排。重排主要包括重复序列和同源染色体的删除。然而,在脊索动物群中,有一种叫盲鳗的鱼也会遭受了这种重排。Jeramiah Smith等人发现海七鳃鳗(Petromyzon marinus)在发育过程中剔除了数百万碱基对和至少一个转录位点(transcribed locus)。

     通过流式细胞计量技术(Flow cytometry)研究人员发现,海七鳃鳗在减数分裂后的睾丸细胞中的核DNA量比体细胞大约多20%。海七鳃鳗细胞系含有大量特殊DNA的拷贝数,已经发现的有Germ1,它出现在减数分裂种系(meiotic germline)的一些染色体中。七鳃鳗体细胞的DNA印迹(Southern blot)和荧光原位杂交(FISH)结果表明在其发育后Germ1的拷贝数有大幅的减少。实时PCR检测分析表明大部分Germ1的缺失一般是在该生物从囊胚到原肠胚转变的这个时期发生的。作者进一步解释说,盲鳗和海七鳃鳗的基因组重排表明它们可能有一个共同的进化起源,这个起源可以追溯到现在所有脊椎动物共同祖先的近亲。

      参阅文献:
      Programmed loss of millions of base pairs from a vertebrate genome.PNAS July 7, 2009 vol. 106 no. 27 11212-11217

责任编辑:晓宇
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    海洋生物,基因组
     
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